Tsukuyomi-no-Mikoto, der Mond-Nacht-Besitzer, entsteht, als Izanagi während der Reinigung nach seiner Flucht aus Yomi, dem Land der Toten, sein rechtes Auge wäscht. Zusammen mit seiner Schwester Amaterasu und seinem Bruder Susanoo zählt er zu den drei kostbarsten Kindern, die aus diesem Ritus geboren wurden, und Izanagi setzt ihn ein, um über die Nacht zu herrschen, so wie Amaterasu über den Tag herrscht. Trotz dieses kosmischen Ranges ist auffallend wenig Mythos über ihn überliefert; er ist das schweigsamste der drei edlen Kinder und besitzt im Kojiki nahezu keine eigenständige Geschichte.
Die einzige bedeutende Episode, die mit ihm verknüpft ist und im Nihon Shoki erzählt wird, erklärt, warum Sonne und Mond niemals gemeinsam den Himmel teilen. Von Amaterasu entsandt, um der Nahrungsgöttin Uke Mochi beizuwohnen, beobachtet Tsukuyomi, wie sie ein Festmahl hervorbringt, indem sie Reis, Fisch und Wild aus ihrem Mund hervorwürgt. Angewidert davon, mit Speisen bewirtet zu werden, die er für unrein hält, zieht er sein Schwert und tötet sie:
是時月夜見尊忿然作色曰：「穢哉，鄙矣！寧可以口吐之物敢養我乎？！」廼拔劒撃殺。然後復命，具言其事
“Tsuki-yomi no Mikoto entbrannte in Zorn und sprach: ‚Unrein! Widerwärtig! Dass du es wagen solltest, mich mit Dingen zu speisen, die aus deinem Munde hervorgewürgt wurden!’ Da zog er sein Schwert und erschlug sie, kehrte alsdann zurück und erstattete Bericht, indem er alle Umstände darlegte.” — Nihon Shoki, Buch I; deutsche Fassung nach der englischen Übersetzung von W. G. Aston (Nihongi, 1896)
Amaterasu, entsetzt, weigert sich fortan für immer, ihn je wieder anzusehen, und die beiden trennen sich — der mythische Ursprung dafür, dass Tag und Nacht voneinander getrennt bestehen. Das Kojiki erzählt eine ähnliche Geschichte von einer erschlagenen Nahrungsgottheit, Ogetsu-hime, schreibt diese Tötung jedoch stattdessen Susanoo zu. Tsukuyomi wird heute an einer kleinen Zahl von Schreinen verehrt, darunter Tsukiyomi-no-miya, einem Nebenschrein von Ise.
