伊邪那岐与其妹兼配偶伊邪那美，是最后诞生的原初神明，受诸天神之命，前去『修理固成』下方漂浮不定的国土。二神立于天浮桥之上，以玉矛搅动卤水：
廼以天之瓊〈瓊，玉也，此曰努。〉矛，指下而探之，是獲滄溟。其矛鋒滴瀝之潮，凝成一島，名之曰磤馭慮島
于是垂下天之琼矛向下探寻，得到了苍茫大海。矛尖滴落的海水凝结成一座岛，命名为磤驭虑岛。 — 《日本书纪》卷第一·神代上；白话语译：本站
二神由那座名为淤能碁吕岛的岛屿降临，结为夫妻，生下日本列岛与众多自然神明。伊邪那美因诞下火神迦具土而身亡，伊邪那岐悲痛欲绝，亲手斩杀自己的儿子，并前往黄泉欲寻回爱妻。他见到伊邪那美已然腐烂，遍体爬满蛆虫，违背了不可窥视的誓约，惊恐而逃，以一块巨石封住黄泉入口，伊邪那美则在石的另一侧对他发出诅咒。
重返阳世后，伊邪那岐独自在河中净身，正是这次独自进行的洗涤，孕育出日本最伟大的三位神明：左眼所出为天照大神，右眼所出为月读，鼻中所出为须佐之男。创世之业既已完成，伊邪那岐便隐退于世；传说他最终栖居于淡路岛，如今岛上建有伊弉诺神宫。
